Z le tremi ali štirimi meseci dežja na leto je Colima zaradi številnih potokov, ki prihajajo iz zgornjih delov Volcán de Fuego, lahko izpolnila pogoje za človeško življenje. Dokazi kažejo, da se je človek v tej dolini naselil okoli 1500 pr.
Kultura, imenovana Complejo Capacha, so bile kmetijske in sedeče družbe, ki so ustvarile slavno tradicijo jaškovnih grobnic: mrliške komore, v katerih so deponirali bogato ponudbo in do katerih je bilo mogoče dostopati skozi navpični in okrogli jašek od 1.20 do 1.40 m v premeru. V rekreacijskem središču Tampumachay v mestu Los Ortices so trije grobovi z originalnim jaškom in oboki ter znotraj vrste kamnitih posod in orodij, ki se ponujajo mrtvim.
Ko je imela religija večjo težo v družbeni organizaciji, so se od 600 našega štetja začeli graditi svečani prostori iz trgov, razmejenih dvorišč in pravokotnih ploščadi pomembnih dimenzij. Arhitekturno bolj zapletena naselja so se razvila šele po letu 900 našega štetja.
Kraj, ki najbolje predstavlja to etapo, je La Campana. Je veliko naselje - njegova slovesna površina je presegala 50 hektarjev - z zaporedjem pravokotnih ploščadi. Na vrhu teh ploščadi so območja, ki so verjetno povezana s skladiščenjem žita. Obstajajo tudi zapleteni bivalni sistemi, ki so jih nedvomno morali zasedati civilni in verski voditelji.
Na tem mestu izstopata dva vidika: lokacija grobnic, integriranih v svečane prostore, in obstoj zapletene mreže odvodnih in vodovodnih kanalov.
Drugo pomembno arheološko najdišče v Colimi je El Chanal, ki se nahaja približno 6 km severno od mesta in je moral imeti največ 200 hektarjev površine. Ker se je razširil na oba brega reke Colima, je znan kot El Chanal Este in El Chanal Oeste. Slednja, čeprav ni bila v celoti raziskana, kaže očitno zapletenost, saj ima dvorišča, trge, zgradbe, kanale in ulice. El Chanal Este pa je bil večinoma uničen, ker je moderno mesto, ki nosi njegovo ime, nastalo na ruševinah.
Preiskave kažejo, da so v kraju indikativni elementi dvojnega templja, koncept oltarne klopi in oltarjev-ploščadi majhnih dimenzij ter veliko število razsutih skulptur, gravur in kamnitih reliefov; številke, povezane s ksantili; polikromirana keramika, ki tvori obrise orlov in pernatih kač; in končno kovina. Toda najbolj izstopajoča stvar te kulture je prisotnost urbanega pojava in obstoj koledarja.
