Calleja je bil med osamosvojitveno vojno organizator in vodja osrednje vojske (1810–12) in šestdeseti podkralj Nove Španije, ki je vladal med 1813 in 1816, in je bil eden največjih zlikovcev v zgodovini Mehike.
Rodil se je v Medini del Campo v Valladolidu in umrl v Valenciji. Prvo kampanjo je opravil kot podporočnik v nesrečni odpravi v Alžiru, ki jo je v času vladavine Karla III. Vodil grof O'Reilly. Bil je učitelj in kapitan čete 100 kadetov, med katerimi sta bila Joaquín Blacke, regent po Španiji, in Francisco Javier de Elío, bodoči podkralj Buenos Airesa, na vojaški šoli v Puerto de Santa María.
V Novo Španijo je prispel z drugim grofom Revillagigedom (1789) kot kapetan, pritrjen v fiksni pehotni polk Puebla, in uspešno opravljal več nalog, dokler ni bil imenovan za poveljnika brigade San Luis Potosí. Tam je imel pod svojim poveljstvom kanton vojakov, ki ga je zbral podkralj Marquina, ki se ga je s svojo četo udeležil kapitan Ignacio Allende. Tam se je tudi poročil z Doño Francisco de la Gándara, hčerko kraljevega praporščaka tega mesta, ki je bila lastnica velike Haciende de Bledos; in dobil je velik vpliv na prebivalce države, ki so ga poznali kot "mojstra Don Félixa".
Ko je prišlo do vstaje Hidalga, je ne da bi čakal na ukaze podkralja, dal čete svoje brigade na orožje, jih povečal z novimi in jih organiziral in discipliniral ter oblikoval majhno (4000 mož), a močno vojsko centra, ki ji je uspelo premagati Hidalgo in se sooči z grozljivo ofenzivo, ki jo je začel Morelos.
Calleja se je po obleganju Cuautle (maja 1812) umaknil v Mehiko, v svoji rezidenci (Casa de Moncada, kasneje pa Palacio Iturbide) pa je imel svoje majhno sodišče, kjer se je strinjalo nezadovoljstvo z vlado Venegasa, ki so mu očitali pomanjkanje denarja in nemočen, da zadrži in konča revolucijo. Približno 4 leta kasneje je državi vladal kot podkralj. Dokončal je vojsko, tako da je dosegla 40.000 mož linijskih čet in provincialnih milic, in prav toliko rojalistov se je organiziralo po vseh mestih in posestvih, nekateri so odšli večinoma iz provinc, ki so bile v revoluciji; reorganiziral je javno blagajno, katere izdelki so se z novimi davki povečali; ponovno je vzpostavila trgovski promet s pogostimi konvoji, ki so spet krožili z enega konca kraljestva na drugega in z rednimi poštnimi storitvami; in povečali uspešnost in carinske izdelke.
To predpostavlja neprekinjene in intenzivne kampanje, ki jih je spodbujal proti vstajnikom, v katerih je Morelos podlegel. Odločen in brezvesten človek se ni ustavil v medijih in si zatisnil oči pred zlorabami, ki so jih storili njegovi poveljniki, če so z resnično stvarjo služili z vnemo. Tako je postal sovražen do svojih sodobnikov.
Vrnjen v Španijo je prejel naslov grofa Calderóna (1818) in velika križa Isabel la Católica in San Hermenegildo. Potem ko je bil general-kapetan Andaluzije in guverner Cádiza, je imel poveljstvo ekspedicijskih čet Južne Amerike, ki so se pred odhodom dvignile in ga zaprle v zapor (1820). Izpuščen je zavrnil vlado v Valenciji in bil ponovno zaprt na Mallorci do leta 1823. "Prečiščen" leta 1825 je ostal v vojašnici v Valenciji do svoje smrti.
