Rojen v Comu v Italiji leta 1702 plemenitega rodu. V Španiji, kamor pobegne pred vojno v Avstriji, dobi široka pooblastila za pobiranje pokojnine potomcev Moctezume v kraljevskem Cajasu v Mehiki.
V Novo Španijo je odpotoval leta 1736. V osmih letih bivanja se je posvetil raziskovanju prikazni Device Guadalupe in zbral veliko grafičnega in piktografskega gradiva. Spodbuja kronanje podobe Guadalupana, kar povzroča nezaupanje podregalnih oblasti. Ujet je in njegova zbirka je odstranjena. Nekaj mesecev kasneje se po izgonu v Španijo vkrca na ladjo, ki pade v roke piratom, ki ga zapustijo v Gibraltarju.
Z velikimi deli je prispel v Španijo in stopil v stik z zbirateljem Marianom Fernándezom de Echeverríay Veytijo, ki je dosegel oprostilno sodbo, ko je bil imenovan za kraljevskega kronista Indije, kar je Boturini zavrnil, da bi se posvetil pisanju zgodovine avtohtonih ljudstev. Čeprav zbirke nikoli ne obnovi, je nanjo napisal Katalog indijskega muzeja. Njegovo delo je zelo izvirno in dobro dokumentirano. Umrl je v Madridu na negotov datum med letoma 1750 in 1755.
