Verniki, ki so vstopili na nenaseljena ozemlja severa Nove Španije, so si zamislili, da bi "barbarske" narode spreobrnili v krščanstvo in jih tako tudi vključili v politično življenje, da bi kasneje v vaseh, ki so jih prej ustanovili, našli šole in mesta.
Da bi dosegli te cilje, so se starši v spremstvu oboroženih skupin obrnili na pogane in jim ponudili zaščito pred Cerkvijo in špansko krono v zameno za krščansko izobrazbo. Indijanci, ki so to sprejeli, so se zbrali, da bi ustvarili misijo in postali zatočišče za Indijance ter kraj za učenje evropskih tehnik kmetijstva in drugih obrti.
Ko je bila pacifikacija končana, je misija postala novo mesto s cerkvijo, medtem ko so se misijonarji preselili drugam, da bi ponovno začeli s svojim evangelizacijskim delom. Ta sistem je bil tvegan, ker so se severni Indijanci zagotovo nekoliko upirali, saj so bili bolj sovražni kot tisti v središču, in so bežali proti goram.
Pretvorba je delovala na podlagi podelitve zemljišč in zaščite Indijancev v zameno za poslušnost. Tisti, ki so nasprotovali, so bili kaznovani, tisti, ki so organizirali upor, pa usmrčeni.
Ko je bilo domorodno pleme sestavljeno, je bilo integrirano glavno jedro ali glava, ki jo je sestavljalo več mest in rančev, ki so ji bili podrejeni. Misijonarji so prebivali v povirju in so bili zadolženi za vsaj dve obisk vasi. Trije ali več misijonarjev je bilo odvisno od rektorja in lokalnega obiskovalca. Te ustanove so skupaj tvorile provinco.
Najprej je bila postavljena kamnita cerkev, okoli nje pa so z adobe zgradili hiše za brate, ki bodo evangelizirali, sonce, kocke in avtohtone družine ter na splošno šolo. V obratih je obstajala tako imenovana primitivna gospodarska struktura. Imeli so površine za obdelavo, sejanje zemlje, odpiranje cest in namakalnih kanalov; govedoreja, zelenjava in obrtniška dejavnost. V šolah so poučevali katekizem, branje, pisanje in glasbo.
Sčasoma so nekatere misije zaradi različnih dogodkov popolnoma opustili, na primer izgon jezuitov leta 1767, širjenje bolezni, ki so jih prinesli Španci, napadi "barbarskih" Indijancev, vremenske razmere, dolge razdalje in malo denarja za njihovo vzdrževanje. Nekatere so danes ohranjene kot cerkve, druge pa danes predstavljajo zelo pomembne populacije. Vendar je pri nekaterih misijah znano le mesto njihove začetne lokacije, pri drugih pa ostanejo le ruševine.
Jezuiti so ustanovili misije v Baja California Norte in Sur, Sonora, Sinaloa, Chihuahua, severni Nayarit, del Duranga in Coahuile. Po njihovem odhodu so se dominikanci naselili severno od Baje Kalifornije, medtem ko so frančiškani evangelizirali Tamaulipas in Nuevo León in zamenjali misijonarje reda Loyola v južnem delu Baja California, Sonora, Sinaloa, Chihuahua, Nayarit, Durango in Coahuila. V severnem središču so se domačini po uporu Zacatecosov, ki je frančiškanskim misijam preprečeval nadaljevanje, organizirali v samostane.
Leta 1563 je kapitan Francisco de Ibarra obiskal ozemlje, ki vključuje sedanjo državo Sinaloo, in ustanovil nekatera mesta. Vendar so to trajalo kratek čas in šele leta 1591 je bilo z ukazi guvernerja Nueva Vizcaya očetoma jezuitoma Gonzalo de Tapia in Martín Pérez naročeno, da evangelizirajo regijo.
Verniki so maja istega leta prečkali Sierro Madre Occidental, vstopili skozi Acaponeto v Nayaritu in skozi Culiacán prispeli do mesta, kjer so 6. junija 1591 ustanovili svojo prvo stavbo: San Felipe de Sinaloa.
